@isTest(SeeAllData=true)
はよろしくない。
他のカスタムオブジェクトと同様にテストデータを作成してあげてください。
以下は、DefaultRecordCount というAPI参照名を指定したカスタム設定の例です。
private static void dummyCustomDataInsert() {
// カスタム設定のダミーデータを作成
DefaultRecordCount__c obj = new DefaultRecordCount__c();
obj.startDt__c = System.today();
obj.cnt__c = 24;
insert obj;
}